銀河を二分した百年戦争の終戦後を舞台に、主人公・キリコのハードな生き様を描くロボットアニメアニメーション。
キリコたちが搭乗するAT（アーマードトルーパー）は、徹底的に兵器として描写され、後の作品にも多大な影響を与えた。TVシリーズ終了後もオリジナルビデオアニメーションが制作されたほか、現在も新たな企画が展開されており、その世界を広げている。

ギルガメスとバララント、アストラギウス銀河を二分する百年戦争末期。
仲間すらあざむく特殊作戦に赴いたキリコ・キュービィーは、そこで「素体」と呼ばれるフィアナとの運命的な出会いを果たす。結果的に軍からも追われる身となったキリコは、戦場を彷徨しながら自分に課せられた宿命を知る……。

ウドの地獄から脱出したキリコを待っていたのは、さらなる戦場への誘いだった。グレゴルー、バイマン、ムーザ……通称「レッドショルダー」として共に戦った仲間たちは、レッドショルダー創始者「ヨラン・ペールゼン」へ復讐すべく牙を研いでいた。ペールゼンの背後に秘密結社があると知ったキリコは、フィアナへの想いを胸に戦友たちと行動を共にする。だがその時、秘密結社では新たなパーフェクト・ソルジャー「イプシロン」が誕生していた。人のエゴが作りし完璧な兵士を前に、キリコは何を思うのか。

アストラギウス銀河の影の支配者、ワイズマンを消滅させたキリコ……。その後、ニュートラルシティのア・コバにたどり着いたキリコは、さらわれたフィアナを救い出すため再びバトリングへ身を投じる。対するはバララントが作り上げたＰＳ（パーフェクトソルジャー）、ニーヴァ。レッドショルダーに恨みを持つニーヴァに、キリコは肩を赤く染めたスコープドッグで立ち向かう。
PS対異能者、地上戦艦対ATの前代未聞のビッグバトルが始まる……。